㈠ 靶向代谢组学和非靶向代谢组学的区别
靶向代谢组学新技术,区别于传统的非定向代谢组学,具有如下优势:
1.样品种类多:生物流体(血液、尿、唾液、肠道微生物)、环境样品、细胞、动植物组织、污水、药品、食品。
2.化合物涵盖广:包括脂类、维生素、核苷酸、神经递质等700种代谢产物,涵盖所有主要代谢途径。
3.分析时间短:我们的方法能在30min同时测定并准确鉴定出700种化合物。
4.复杂的数据处理:专业的数据处理方法和软件,能对所得数据进行PLS-DA,PCA,ANOVA,VIP,Biomarker等分析。
㈡ 哪些单位能做微生物代谢组学的测定
靶向代谢组学新技术,区别于传统的非定向代谢组学,具有如下优势: 1.样品种类多:生物流体(血液、尿、唾液、肠道微生物)、环境样品、细胞、动植物组织、污水、药品、食品。 2.化合物涵盖广:包括脂类、维生素、核苷酸、神经递质等700种代谢产物,涵盖所有主要代谢途径。 3.分析时间短:我们的方法能在30min同时测定并准确鉴定出700种化合物。 4.复杂的数据处理:专业的数据处理方法和软件,能对所得数据进行PLS-DA,PCA,ANOVA,VIP,Biomarker等分析。
㈢ 微生物代谢,微生物生长,微生物发酵有什么不同
微生物代谢是指微生物吸收营养物质维持生命和增殖并降解基质的一系列化学反应过程。有机物的降解和微生物的增殖如图所示,分解代谢中,有机物在微生物作用下,发生氧化、防热和酶降解过程,使结构复杂的大分子降解;合成代谢中,微生物利用营养物及分解代谢中释放的能量,发生还原吸热及酶的合成过程,使微生物生长增殖。、内源呼吸,则是细胞质进行自身氧化并放出能量的过程。当有机物充足时,细胞质得到大量合成,而内源呼吸则并不显着;当缺乏营养时,则只能通过内源呼吸吸收氧化自身的细胞物质而获得微生物生命活动所需的能量。
微生物生长:微生物有机体的细胞组分与结构在量方面的增加。
微生物生理学严格定义的“发酵”:
有机物被生物体氧化降解成氧化产物并释放能量的过程统称为生物氧化。
微生物生理学把生物氧化区分为呼吸和发酵,呼吸又可进一步区分为有氧呼吸和无氧呼吸。因此,发酵是生物氧化的一种方式。
发酵是这样一种生物氧化方式:在没有外源最终电子受体的条件下,化能异养型微生物细胞对能源有机化合物的氧化与内源的(已经经过该细胞代谢的)有机化合物的还原相耦合,一般并不发生经包含细胞色素等的电子传递链上的电子传递和电子传递磷酸化,而是通过底物(激酶的底物)水平磷酸化来获得代谢能ATP;能源有机化合物释放的电子的一级电子载体NAD,以NADH的形式直接将电子交给内源的有机电子受体而再生成NAD,同时将后者还原成发酵产物(不完全氧化的产物)。
细胞中的NAD是有限的,如果作为一级电子载体的辅酶NAD不能得到再生,就不能被回用,有效的电子载体就会愈来愈少,脱氢反应就不能持续进行下去了。因此辅酶NAD的再生是生物氧化(包括发酵)继续进行下去的必要条件。
㈣ 马上就要研究生预报名了,关于华中农业大学微生物专业的导师选择谁能给我点建议
我有同学在那里,最好选你喜欢的方向,导师其次,找容易就业的(如果不想考博的话~~)现在只是报名,还没选导师
㈤ 代谢组学样本数目求助
代谢组学的代谢通路富集分析和MYROLE该怎么用
代谢组学是对一系列相似的生物样本中的代谢物进行比较分析的学科。代谢物在生物系统中起着至关重要的作用,因此代谢组学可用于发现和鉴定生物标志物,或更好地了解物或疾病对已知和未知生物通路的影响。成功的代谢物组学研究依赖于有效的代谢物提取。对于非靶向代谢组学研究,需要提取细胞和体液中的多种代谢物,并去除无需分析的蛋白质等成分。再加上代谢物的理化性质多样,丰度动辄相差若干数量级,更进一步增加了提取的难度。液液萃取这种两相分离方法常被用于代谢物的提取。液液萃取中有机溶剂和水溶液的性质、体积、溶剂比例、水溶液的pH 值都必须仔细考虑。这些因素会显着影响提取的代谢物数量和实验的重现性。本应用报告介绍了采用液液萃取提取红细胞代谢物的方法。结果表明,调整水相/有机相的比例对于两相分离非常重要。同时水相pH 值对提取的代谢物数量也有很大影响,为了提取尽可能多的代谢物,需要采用多个pH 值进行提取。
㈥ 土壤检测一般检测哪些项目
一般情况下,要测定土壤污染指标:铜、锌、铅、镉、总汞、总砷、全硒、镍、总铬、氡浓度、氟化物、氯离子、硫酸根离子、有机磷农药等。
㈦ 微生物群落结构分析的意义何在
微生物群落是广泛存在于生态系统中的一种结构单位和功能单位,它们是生态系统内充满生气的一部分,群落中各种不同的种群能以有规律的方式共处,同时它们具有各自明显的营养和代谢类型。从某种意义上说,群落的发展导致了生物的发展。在一定区域里,或一定生境里,各种微生物种群相互松散结合,或有组织紧凑结合的一种结构单位。在微生物群落中各种群之间相互作用。 微生物群落结构分析的意义能够更好的把握个菌种之间的共,寄生等和谐的生活关系。比如通过对肠道菌群的分析。
㈧ 如何看待代谢组学的前景
代谢其实可以理解为生物反应的终端,内源或外源的一点扰动在代谢层面反映出来的影响都是非常大的,相比于蛋白质组学,他研究的对象更为复杂,传统的代谢组研究一般都是通过NRM进行的,这个方法是比较准确的,尤其在定性方面,但是它的灵敏度有限,在定量方面基本是很难做到的,或者说是很不准确的。所以现在我们一般都采用质谱的方法,用GS-MS或LC-MS进行研究,GS-MS它是有公共数据库的,可以做定性分析,但是对你样本性质是有要求的,对于不能气化的样本就没办法适用了,所以其实还是用LC-MS多一些,不过就像上面那位同仁提到的,LC-MS现在是没有公共数据库的,因为代谢组研究你的仪器平台对实验结果还是有影响的,所以一般需要根据你的仪器平台水平来自建标准品库,所以用LC-MS很难做到定性,也可以说想做代谢定性代价很大,不过做定量的话还是很简单的 代谢组最近几年已经慢慢成为热点了,发的文章的数量和水平都逐年递增,他主要还是应用在医学上比较多,寻找标志诊断物,尤其对于中医,代谢组学可以说是非常非常重要的,通过代谢组学可以从数据上支持很多中医诊断理论,当然,在其他领域也是可以应用的
㈨ 微生物做代谢组学分析的样品怎么处理
微生物代谢组学主要研究细胞生长或生长周期百某一时刻细胞内外所有低分子量代度谢物。分析技术的不断发展促进了微生物代谢组学研究的进展。本文结合微生物样品前处理方法,
综述了目前研究中所采用内的各种分析技术的特点与应用,
并展望微生物代谢组学研究中容分析技术的发展趋势。