㈠ 回文结构和反向重复序列
六版生化讲II类酶识别dna位点的核苷酸序列呈二元旋转对称,这种特殊的结构序列为回结构{lalindrome}如
5'-gaattc-3'
3'-cttaag-5'
下面一行反着读和上面一行一样
反向重复序列
{inverted
repeat
sequence}:
在同一多核苷酸链内的相反方向上存在的重复的核苷酸序列。在双链DNA中反向重复可能引起十字形结构的形成。
tatagcGCTATA
ATTACGcgatat小写部分就是反向重复
特别给你翻得书。给分吧
杂还不明白呢?只要双链中的一条反方向读和另一条一样就是回文结构啊!
5'-gaattc-3'
(1)
3'-cttaag-5'
(2)
第二行倒过来读不就是5'-gaattc-3'么?是不是和第一行一样?这种类似的就是回文结构
㈡ 什么是回文结构
双链DNA中含有的二个结构相同、方向相反的序列称为反向重复序列,也称为回文结构,每条单链以任一方向阅读时都与另一条链的序列是一致的。回文结构序列是一种旋转对称结构,在轴的两侧序列相同而反向。
㈢ 回文结构是什么意思
回文结构的意思是:双链DNA中含有的两个结构相同、方向相反的序列称为回文结构,每条单链以任一方向阅读时都与另一条链以相同方向阅读时的序列是一致的。回文结构序列是一种旋转对称结构,在轴的两侧序列相同而反向。当然这两个反向重复序列不一定是连续的。
回文结构在某些因素作用下,可形成茎环式的十字形结构和上面提到的发夹结构,这些结构形式都可以互相转变。回文结构普遍存在于细胞的DNA分子中,与遗传信息表达的调控和基因转移有关。Y染色体的5000万个碱基对中,约有600万个处于回文结构中,使得Y染色体在一定程度上能够自我修复有害的基因变异。
(3)化学回文结构怎么判断扩展阅读:
遗传学上讲的回文序列是双链DNA或RNA分子中的特定的核苷酸片段,该片段在其中一条链上按5'到3'读取的序列与其互补链上按相同的5'到3'读取的序列一致。回文序列的单链DNA或RNA,存在对称中心,对称中心两侧碱基关于该对称中心对称,可形成互补。
故回文序列能够形成发夹结构(茎环结构)。回文序列广泛存在于各种生物体基因组中,主要和转录终止有关,也是限制性内切酶酶切位点,还参与DNA复制等生命活动。
㈣ 名词解释:回文结构
回文,也写作“回纹”、“回环”。它是汉语特有的一种使用词序回环往复的修辞方法,文体上称之为“回文体”。
㈤ 如何进行dna回文序列分析
分析:
回文结构序列是一种旋转对称结构,在轴的两侧序列相同而反向。当然这两个反向重复序列不一定是连续的。短的回文结构可能是一种特别的信号,如限制性内切酶的识别序列。较长的回文结构容易转化成发夹结构,此种结构的形成可能有助于DNA与特异性DNA结合蛋白结合。
特征与功能:
回文序列的一般特征: 有对称轴 ; 是自我互补的序列 ; 两条链从 5 ‘ 到 3 ‘方向的序列一致 ; 是 II 类限制酶的识别序列 ;是某些蛋白的识别序列 ; 是基因的旁侧序列。
结构:
其特点是在该段的碱基序列的互补链之间正读反读都相同(并非在同一条链上正读反读)。
例如:
在双链中,形成十字架结构
5' GGTACC 3'
㈥ 判断是否是回文的条件
buf[i] != buf[strlen(buf)-i-1]
㈦ 请问如何分析一个基因中的回文结构
盼各位大牛提供点思路!谢谢了!回文结构序列是指顺读和反读都一样的序列,广泛存在于各种生物体基因组中。它可以在质粒、病毒和细菌基因组DNA以及真核染色体和细胞器中找到,并且广泛分布于人类癌细胞中。很多蛋白质的结合位点是回文结构:转录因子的结合位点,还有终止子也通常是回文结构。编码小RNA和其它非翻译RNA的基因很多片段也是回文结构。很多功能位点都是回文结构。
有几篇文献供参考。
Computational Methods in Science and Technology 5, 21-24 (1999)SEARCHING FOR PALINDROMIC SEQUENCES IN PRIMARY STRUCTURE OF PROTEINS
Palindrome Patterns in Genomes Arthur Chun-Chieh Shih, D. T. Lee , Chi-Fang Chin, Hong-Yuan Mark Liao, and Wen-Hsiung Li
bioinformatics 2000 vol 16 no 11 page 968-977
BBRC 316 (2004) 755–762 The relationship between palindrome avoidance and intragenic codon usage variations: a Monte Carlo study Anders Fuglsang
BBRC 310 (2003) 280–285 Distribution of potential type II restriction sites
(palindromes) in prokaryotes Anders Fuglsang
Theoretical comupter science 292 (2003) 9-31
Pattern Recognition 35 (2002) 2581–2591 Finding approximate palindromes in strings
你讲的是DNA或者RNA的。蛋白质的回文序列有没?谢了。
qigai wrote:回文结构序列是指顺读和反读都一样的序列,广泛存在于各种生物体基因组中。它可以在质粒、病毒和细菌基因组DNA以及真核染色体和细胞器中找到,并且广泛分布于人类癌细胞中。很多蛋白质的结合位点是回文结构:转录因子的结合位点,还有终止子也通常是回文结构。编码小RNA和其它非翻译RNA的基因很多片段也是回文结构。很多功能位点都是回文结构。
有几篇文献供参考。
㈧ 生物化学中的回文结构 为什么GAGAGAGA不是 为什么GCATATGC是
你没发现后者是前后相互互补的吗 g和c a和t 第一个不是回文结构 老师是这么说的
㈨ 回文结构
楼上错了吧,只有第2个是回文结构!
回文就是双螺旋DNA按确定的方向读双链中的每一条链的序列都一样,就好像上面的第2个,
5‘TCTCTCTCTCTCTCAGAGAGAGAGA’3
3‘AGAGAGAGAGAGAGTCTCTCTCTCT’5
两条链从5’到3’都TCTCTCTCTCTCTCAGAGAGAGAGA
反向重复与回文结构不同,反向只是双链DNA包含的一条链包含两段互补序列,这两段序列之间可以有其它任意脱氧核糖核苷酸,如:
NNNGAAGGTCCNNNGGACGTTCNNN
NNNCTTGCAGGNNNCCTGCAAGNNN(N代表任意脱氧核糖核苷酸)
每一条链都包含两段互补序列!
希望我解释清楚了!!