❶ 如何根据遗传距离判断是否能够鉴别两个种
大于50个遗传单位的遗传距离说明这两个基因可以看做是自由组合而不连锁.在物理图谱上则说明这两个基因在染色体上相距离很长,是必定会发生交换,甚至二次交换的. ————————————————————————————————— （我是一楼）首先你要知道,最开始还没有染色体测序的时候,是靠交换率来确定两个基因的距离的,因此规定了1%的交换率表示两个基因相隔1cM.由于由配子数计算来的交换率一定是小于50%的,因此早期认为50%就是自由组合了. 但是,随着研究的深入,人们发现了基因距离和碱基数的关系.也就是说1cM的基因距离,一般相当于50万~100万个碱基对（对于人类染色体来说）.后来,人们不用交换率来测量基因距离了,而是靠基因间的碱基数衡量基因距离,而厘摩这个单位因为使用广泛,并且在衡量配子交换率时也有用处,因此就流传了下来.但是,有些染色体是长于5000万碱基对的,因此换算的话就成了100多厘摩的距离.明白了吧? 其实,长于50厘摩,相当于两个基因间距离很长,总能够发生交换,但是,不能理解为长于50厘摩就是交换率大于50%,这点是不合适的.
❷ 地理图怎么看经纬度
1、上北下南，左西右东。
2、东西方向延伸的是经线，南北方向延伸的是纬线。
3、纬度中，越向北越大，表示北纬，越向南越大，表示南纬。
4、经度中，越向东越大，表示东经，越向西越大，表示西经。
5、结论：A为南纬40度，西经40度 ；B为北纬40度，东经40度；C为北纬10度，西经170度；D为南纬10度，东经170度。
❸ mantel检验如何操作 补充说明下：我想做地理距离和遗传距离这两个矩阵之间的相关分析，即mantel检验。
用TFPGA软件 就可以做出来
❹ 什么是遗传距离
遗传距离(genetic distance) 衡量品种间若干性状综合遗传差异大小的指标。育种目标所要求的性状不止一个,为了能够更全面地反映亲本品种间的遗传差异,需要对多个性状综合考虑,从而引伸出遗传距离的概念。
❺ 遗传距离和物理距离的异同点
异在于表示的单位不一样，一个是厘摩，一个是核苷酸；前者是相对距离，后者是实际距离。
同在于两者都是线性排布，都可反应基因或者标记的先后顺序，都是将一些相关的基因或者标记定位在某一染色体上（遗传图谱的连锁群，物理图谱的叠连群）。
❻ 怎样估算遗传距离
遗传距离指个体、群体或种之间用DNA序列或等位基因频率来估计的遗传差异大小。衡量遗传距离的指标包括用于数量性状分析的欧式距离（D），可用于质量性状和数量性状的Gower距离（DG）和Roger距离（RD），用于二元数据的改良Roger距离（GDMR）、Nei&Li距离（GDNL）、Jaccard距离（GDJ）和简单匹配距离（GDSM）等：
D=[（x1-y1）2+（x2-y2）2+…（xp-yp）2]1/2，这里x1，x2，…，xp和y1，y2，…，yp分别为两个个体（或基因型、群体）i和j形态学性状p的值。
两个自交系之间的遗传距离Dsmith=∑[（xi（p）-yj（p））2/varx（p）]1/2，这里xi（p）和yj（p）分别为自交系i和j第p个性状的值，varx（p）为第p个数量性状在所有自交系中的方差。
DG=1/p∑wkdijk，这里p为性状数目，dijk为第k个性状对两个个体i和j间总距离的贡献，dijk=｜dik-xjk｜，dik和djk分别为i和j的第k个性状的值，wk=1/Rk，Rk为第k个性状的范围（range）。
当用分子标记作遗传多样性分析时，可用下式：d（i，j）=constant（∑｜Xai-Xaj｜r）1/r，这里Xai为等位基因a在个体i中的频率，n为每个位点等位基因数目，r为常数。当r=2时，则该公式变为Roger距离，即RD=1/2[∑（Xai-Xaj）2]1/2。
当分子标记数据用二元数据表示时，可用下列距离来表示：
GDNL=1-[2N11/(2N11+N10+N01)]
GDJ=1-[N11/(N11+N10+N01)]
GDSM=1-[(N11+N00)/(N11+N10+N01+N00)]
GDMR=[(N10+N01)/2N]0.5
这里N11为两个个体均出现的等位基因的数目，N00为两个个体均未出现的等位基因数目，N10为只在个体i中出现的等位基因数目，N01为只在个体j中出现的等位基因数目，N为总的等位基因数目。谱带在分析时可看成等位基因。
在实际操作过程中，选择合适的遗传距离指标相当重要。一般来说，GDNL和GDJ在处理显性标记和共显性标记时是不同的，用这两个指标分析自交系时排序结果相同，但分析杂交种中的杂合位点和分析杂合基因型出现频率很高的群体时其遗传距离就会产生差异。根据以前的研究结果，建议在分析共显性标记（如RFLP和SSR）时用GDNL，而在分析显性标记（如AFLP和RAPD）时用GDSM或GDJ。GDSM和GDMR，前者可用于巢式聚类分析和分子方差分析（AMOVA），但后者由于有其重要的遗传学和统计学意义而更受青睐。
在衡量群体（居群）的遗传分化时，主要有三种统计学方法：一是χ2测验，适用于等位基因多样性较低时的情形，二是F统计（Wright，1951），三是GST统计（Nei，1973）。在研究中涉及到的材料很多时，还可以用到一些多变量分析技术，如聚类分析和主成分分析等等。
❼ 遗传距离与物理距离之间有什么联系吗或者说物理距离会对遗传距离有什么影响吗
遗传距离与物理距离成正比。这是因为人的长相与骨骼的结构形状与食物有密切关系。比如某民族的特征是蒜头鼻子，夫妻二人如果在汉地生活的话，他们的儿女虽然仍然有本民族的特征，但是在其民族看来已经有所区别。也就是水土决定的。
❽ 根据遗传距离怎么做聚类图，求指点
你先不用着急，好好看看相关文献！
这好这几天我也在做聚类分析，所谓聚类分析就是根据遗传距离或相似系数把遗
传距离小的或相似系数大的样品聚为一类，然后应用可生成树状图以便观
察。
如还不明白可继续提问。
❾ 遗传学中遗传距离cM与碱基kb 之间如何换算
你好！
举个例子你就懂了。人类基因组遗传距离3300cM，基因组测序3000MB，接下来怎么算应该不用我说。一般而言，水稻的1cM大概750bp左右，大豆棉花也在1000左右。当然随着遗传图谱的不断加密，1cM的物理距离会渐短的。
如果对你有帮助，望采纳。
❿ 能用ntsys软件计算遗传距离和地理距离的mantel检验吗
利用NTSYS软件计算品种间遗传距离：
1．将已赋值好的Excel文件放于桌面，假设命名为A.xls，保存为Microsoft office 5.0/95工作薄形式。Excel文件格式设成软件识别的模式，即A1=1，表示出现等位基因；B1=132，表示等位基因数，C1=189表示品种数；D1=0表示不出现等位基因。从A3开始，在第一列标上所有的SSR引物，从B2开始，第二行标上所有的品种名，由此得到一个数据矩阵。
2．双击NTSYS软件，选择file→edit file，选择A.xls文件，将出现NTedit1.2编辑器，点击file→sale file as选项，将导入的Excel文件转换为软件识别的格式，命名为A-1.NTS文件。
3．点击Ntsyspc2.1界面的“Similarity”，点击“Genetic distance”；在Input data file中输入A-1.NTS；在Output file中输入A-2.NTS，点击Compute；则计算好的遗传距离放在A-2.NTS文件中。
4．点击Ntsyspc2.1界面的output&transf→output→Input file，选择A-2.NTS，即可查看到品种间的遗传距离。
地理距离矩阵 ：
A B C D
==================================================
A 0
B 1061.38 0
C 1502.5 770.26 0
D 1130.1 788.052 474.616 0
==================================================
遗传距离矩阵 ：
pop ID a b c d
==================================================
a 0
b 0.1282 0
c 0.2010 0.0985 0
d 0.1604 0.1058 0.1388 0
==================================================
TFPGA做Mantel检验输入格式 ：
1，2， 0.1282，1061.38
1，3， 0.2010，1502.50
1，4， 0.1604，1130.10
2，3， 0.0985，770.26
2，4， 0.1058，788.052
3，4， 0.1388，474.616
0，0， 0，0
前两列数字为第i列第j列label；
注意j一定小于i ；
后两列为需要比较的两个矩阵的对应元素 ；
Matrix Size就是矩阵的大小 ；
两个矩阵必须大小相同。