怎么查找基因的物理位置

‘壹’ 如何查找正常人某个基因位点是G还是C

如果你知道这个位点的RS号，可以直接在ncbi的dbSNP数据库网站查询，输入rs号后的搜索结果里会显示这个位点的信息，如下：该位点野生型是G，突变型是A。

如果不知道rs号，其他的如该位点在染色体上的绝对位置，也就是上图的“position”也可以在ncbi等多个数据库网站查询。如果一概不知，只知道基因名称，也可以去ncbi查找该基因的全序列，去看这个位置是G还是C。

总之，ncbi上就可以查到。

‘贰’ 如何查找基因的基本信息

NC表示人类基因组DNA的RefSeq。（链接序列）

NM表示mRNA的RefSeq。

NP表示蛋白质的RefSeq

查找基因的基本信息的方法如下:

1. 根据文献中已知的基因ID如果你在文献中看到你感兴趣的基因，而且文中还提到了

基因在Genbank中的ID号，那就好办了，直接打开http://www.ncbi.nlm.nih.gov ，在Search后的下拉框中选择Nucleotide，把Genbank ID号输入GO前面的文本框中，点“GO”，就可以找到了。(如GenBank accession number gi 16151096)”。

2. 根据已经获得的基因的相关信息进行查找，打开http://www.ncbi.nlm.nih.gov/在search后面的下拉框中选择Gene，然后在中间的文本框中输入基因名称“VEGF”，点击GO。搜索结果出来了，点击箭头所指的Limits, Limits的意思其实就是高级检索，你可以在这里对检索词进行很多限制，这样能大大精简查询结果。我们接着来，在Limits这个界面，先选择查询的限定范围：先选Gene name(基因名称)；然后再选择Limit by Taxonomy（生物分类限定）中的Homo sapiens（人类），然后再点击“GO”。直接点击基因名称“VEGFA”就可以看到有关基因的信息了。需要指出的是，在Genbank中，基因有很多别名（Aliases），和Genbank中记录的名称有可能不一致。比如在这里，VEGFA是Genbank中记录的基因名称，而它还有很多别名，比如MGC70609, VEGF（这就是我们要找的基因名称 ）, VEGF-A, VPF；还有，在这里可以看到该基因在染色体上的位置... 再往下看，可以看到Genomic regions, transcripts, and procts，这里显示了该基因在基因组中的位置，以及转录本的生成情况：就看见了目的基因的mRNA的链接（如NM_001025366.1）和蛋白质的链接（如NP_001020537.2 ） 这里得说两句，有的基因也许只有一个编码序列，但有的基因有很多的mRNA剪接体，但都是归在一个基因名称下面。比如，在VEGF基因下面有7个序列，分别是vascular endothelial growth factor A isoform a, isoform c, isoform d, isoform e, isoform f , isoform g, isoform b precursor ，就需要根据查阅的文献以及在这些基因序列后面的解释来确定了。如果我想找的基因是第一个序列即isoform a, 就可以点击NM_001025366.1，