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怎么构建物理图谱

发布时间:2023-07-18 05:53:46

Ⅰ 物理图谱的构建方法主要有哪几种

物理图谱的构建方法主要有哪几种
研究物理的科学方法有许多,经常用到的有观察法、实验法、比较法、类比法、等效法、转换法、控制变量法、模型法、科学推理法等.研究某些物理知识或物理规律,往往要同时用到几种研究方法.如在研究电阻的大小与哪些因素有关时,

Ⅱ 为什么要构建遗传图和物理图

1.基因组存在大量重复序列,会干扰排序,因此需要高密度基因组图谱
2.基因组太大,必需打断之后分散测序,然后将分散的顺序按原来位置组装,需要图谱进行指导
3.遗传图谱和物理图谱各有优缺点,必须相互整合校正

生物学 EST是什么啊 详细的介绍一下

EST是Expressed Sequence Tag的缩写,意思是表达序列标签,指从一个随机选择的cDNA克隆,进行5’端和3’端单一次测序挑选出来获得的短的cDNA 部分序列。

EST是从一个随机选择的cDNA 克隆进行5’端和3’端单一次测序获得的短的cDNA 部分序列,代表一个完整基因的一小部分,在数据库中其长度一般从20 到7000bp 不等,平均长度为360 ±120bp。

EST 来源于一定环境下一个组织总mRNA 所构建的cDNA 文库,因此EST也能说明该组织中各基因的表达水平。

(3)怎么构建物理图谱扩展阅读

EST的作用表现在:

1、 用于构建基因组的遗传图谱与物理图谱;

2、作为探针用于放射性杂交;

3、 用于定位克隆;

4、借以寻找新的基因;

5、作为分子标记;

6、 用于研究生物群体多态性。

Ⅳ 什么是物理图谱如何用序列标签位点绘制物理图谱

通过遗传重组所得到的基因在具体染色体上线性排列图称为遗传连锁图.它是通过计算连锁的遗传标志之间的重组频率,确定他们的相对距离,一般用厘摩(cM,即每次减数分裂的重组频率为1%)来表示.绘制遗传连锁图的方法有很多,但是在DNA多态性技术未开发时,鉴定的连锁图很少,随着DNA多态性的开发,使得可利用的遗传标志数目迅速扩增.早期使用的多态性标志有RFLP(限制性酶切片段长度多态性)、RAPD(随机引物扩增多态性DNA)、AFLP(扩增片段长度多态性);80年代后出现的有STR(短串联重复序列,又称微卫星)DNA遗传多态性分析和90年代发展的SNP(单个核苷酸的多态性)分析.
 物理图谱是利用限制性内切酶将染色体切成片段,再根据重叠序列确定片段间连接顺序,以及遗传标志之间物理距离〔碱基对(bp) 或千碱基(kb)或兆碱基(Mb)〕的图谱.以人类基因组物理图谱为例,它包括两层含义,一是获得分布于整个基因组30 000个序列标志位点(STS,其定义是染色体定位明确且可用PCR扩增的单拷贝序列).将获得的目的基因的cDNA克隆,进行测序,确定两端的cDNA序列,约200bp,设计合成引物,并分别利用cDNA和基因组DNA作模板扩增;比较并纯化特异带;利用STS制备放射性探针与基因组进行原位杂交,使每隔100kb就有一个标志;二是在此基础上构建覆盖每条染色体的大片段:首先是构建数百kb的YAC(酵母人工染色体),对YAC进行作图,得到重叠的YAC连续克隆系,被称为低精度物理作图,然后在几十个kb的DNA片段水平上进行,将YAC随机切割后装入粘粒的作图称为高精度物理作图.

Ⅳ 如何将10bp的DNA序列在人染色体上定位并图形化显示

构建遗传连锁图谱的软件好多
不同的软件作出的图大差不差
一般常用的有linkagemap1.0或者mapmaker 3.0
南京的去南林大找吧
去林木遗传育种实验室
生物技术大楼5楼
他们作图做的很多
这些软件都很齐全
网上也有免费的软件下载

照你的意思的话你是要作物理图谱
物理图谱的目的就是用分子生物学技术直接将DNA分子标记或基因定位在基因组的实际位置
你那些10bp的DNA序列也就是相当于分子标记
但是物理图的构建比遗传图谱复杂多了
你这个可以采用荧光原位杂交FISH来作图
将10bp的DNA互补序列做成探针直接与染色体进行杂交
通过荧光标记将序列直接显示出位置
STS作图是目前最有效的物理作图方法
通常使用的软件是由Phil Green小组的C. L. Magness等人编写的SEGMAP
物理图谱我没做过不是很清楚
我只能帮你这么多了

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